在广东省《珠江三角洲地区轨道交通同城化规划》中，该省将投入3500亿元以上的资金在2050年前建设总里程近1900公里的城际轨道交通网线，形成以广州、深圳、珠海为中心，覆盖珠三角的广州、深圳、珠海、肇庆、佛山、中山、惠州、江门和虎门9个主要城市并与港澳及广东省其他地区紧密联系的城际轨道交通网络，实现珠三角“内圈成网、外圈连通、覆盖全区、通达四邻”，各城市间1小时互通的城际轨道交通网络。

    穗莞深城际轨道交通是国务院批准的珠三角城际轨道线网规划的主轴线之一。线路连通华南经济重镇广州，高新产业研发基地深圳和IT业迅猛发展、制造业发达的东莞，是珠江三角洲地区轨道交通同城化建设的首个开工项目，也是广东省经贸发展的黄金通道。线路从广州地铁5号线的鱼珠站向南延伸，经庙头、开发区、麻涌、洪梅、沙田、厚街、虎门、长安、松岗、沙井和福永等市镇到达深圳机场，预留从深圳机场到福田站的条件。线路全长86.62公里，设计时速为140公里，开行站站停列车，采用小编组、高密度和公交化的运营模式，全程运行时间60分钟，工期4年。