根据最新设计方案，广深港高铁全长约146公里，其中广深段约116公里，起自广州番禺区石壁的广州南站(新广州火车站)，向东经番禺、东莞至深圳市，在深圳市龙华镇设深圳北站(新深圳火车站)，以隧道穿深圳市福田区(福田站)至皇岗口岸，跨深圳河接香港段；自深圳河深港分界经米埔自然保护区、石岗、九龙市区至终点西九龙站，香港段全线26公里均为隧道和地下车站。

　　广州南站至深圳北站的广深段作为首期工程，至今已累计完成投资80%以上，目前已开始全线铺轨，今年底前可率先建成通车。

　　深圳北站至福田站之间的二期工程也正进入全面推进阶段，其中福田站作为目前内地最大的地下铁路客运车站，也是高铁香港段北上内地的首站枢纽，其主体工程已累计完成投资突破27亿元，今年内计划完成投资12亿元，有望于2012年下半年建成。

　　目前，跨境段工程正在进行隧道施工盾构机采购招投标工作，预计下半年完成招标验收，明年春季之前正式启动跨境段施工，将于2014年与香港段全线贯通通车。